Если вам нужно решать подобные задачи то вам все же нужно будет разобраться с докером и сервисами оркестрации. Для оркестрации можно взять что нибудь более дружелюбное, например ранчер https://rancher.com
Да. Только перед db.users.find(), нужно будет выбрать базу данных use "название базы". Название базы указывается в mongoose.connect() ( в первом параметре где строка с url монги ). Посмотреть все доступные базы в монге show databases
