Дополнительно перейдите на PDO, используйте PREPARED_STATEMENTS, отключите буферизацию и эмуляцию подготовленных запросов в PDO. PHP очень сильно выжирает ресурсы по эмуляции. А с подготовленными запросами MySQL не будет каждый раз парсить сам запрос. Достаточно биндить значения и отправлять.
