<header>
<!-- Header top area start -->
<div class="header-top-area">
<div class="container">
<div class="row">
<div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-8">
<div class="top-contact">
<a href="mailto:[[++email]]"><i class="fa fa-envelope"></i> [[++email]]</a>
<a href="tel:[[++phone]]"><i class="fa fa-phone"></i> [[++phone]]</a>
<a href="#"><i class="fa fa-clock-o"></i> [[++grafik]]</a>
</div>
</div>
<div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-4">
<div class="top-menu">
<ul>
<li><i class="fa fa-map-marker"></i> [[++adress]]</li>
</ul>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<!-- Header top area End -->
<!-- Header area start -->
<div class="header-area">
<div class="container">
<!-- Site logo Start -->
<div class="logo">
<a href="index.html"><h1><img src="[[++logo_top]]" /></h1></a>
</div>
<!-- Site logo end -->
<div class="mobile-menu-wrapper"></div>
<!-- Search Start -->
<div class="dropdown header-search-bar">
<a href="#" class="wshipping-button cta-btn modal2" data-toggle="modal" data-target="#modalAppointment">Оставить заявку </a>
</div>
<!-- Search End -->
<!-- Main menu start -->
<nav class="mainmenu">
[[pdoMenu?
&parents=`0`
&tplOuter=`@INLINE <ul id="navigation">[[+wrapper]]</ul>`
&tpl=`@INLINE <li><a href="[[+link]]" [[+attributes]]>[[+menutitle]]</a>[[+wrapper]]</li>`
]]
</nav>
<!-- Main menu end -->
</div>
</div>
<!-- Header area End -->
</header>
<form action="/menu/pirogi/s_kuritsey_na_sloenom_teste_/action.modal/modelName/FastOrder?_=1569582054397" class="itexform-use-ajax form-vertical" enctype=
"multipart/form-data" id="yw1" method="post" name="yw1">
<div class="itexmodal-padding-content">
<div class="row">
<div class="col-md-4">
<h4>Вы выбрали:</h4>
<img alt="Пирог слоеный с курицей" src="/getimg/158/158/files/core/45_image.jpg"><strong>Пирог слоеный с курицей</strong>
</div>
<div class="col-md-8">
<div>
<label class="required" for="FastOrder_name">Ваше имя <span class="required">*</span></label><input id="FastOrder_name" name="FastOrder[name]" type="text"
value="">
</div>
<div>
<label class="required" for="FastOrder_phoneNumber">Ваш номер телефона <span class="required">*</span></label><input id="FastOrder_phoneNumber_m2b3ba993"
name="FastOrder[phoneNumber]" type="text" value="">
</div>
<div>
<div class="col-sm-12 inpbl personal-info fast">
<input id="ytFastOrder_personalData" name="FastOrder[personalData]" type="hidden" value="0"><input id="FastOrder_personalData" name=
"FastOrder[personalData]" type="checkbox" value="1"><label for="FastOrder_personalData">Я согласен(а) с</label><a href=
"/obrabotka_personalnyih_dannyih/politika_konfidentsialnosti" target="_blank">Политикой конфиденциальности</a> и <a href=
"/obrabotka_personalnyih_dannyih/soglashenie_na_obrabotku_personalnyih_dannyih" target="_blank">обработкой моих персональных данных.</a>
</div>
</div>
<div class="button-row">
<button class="btn no-btn" type="submit">Отправить</button>
</div>
</div>
</div>
</div>
</form>
И id navigation применялся ко всем ul в меню. А так как вызов был через id, то и вызывалось 2 меню.
Вам спасибо большое за помощь, подсказали хоть в каком направлении всё искать.