Столкнулся с такой же лажей с nicescroll 3.6.8
Попробуйте прошлую версию 3.6.6 у меня на ней работало все кроме горизонтального скрола в модальных окнах (на андройде) из за этого и решил попробовать крайнюю версию. Если у когото есть более вразумительное решение с радостью послушаю.
После недолгого копания стало ясно, что проблема известна давно.
https://github.com/inuyaksa/jquery.nicescroll/issu...
https://github.com/inuyaksa/jquery.nicescroll/issu...
https://github.com/inuyaksa/jquery.nicescroll/issu...
Ну и ещё там есть.
Как вариант для себя вижу отключение плагина на моб. платформах
