Например, Tiled (www.mapeditor.org/) самый популярный инструмент для описания карт уровней игр. X на Y таблица, каждая ячейка может содержать в себе любую мета-информацию (по вашему усмотрению, например, ID картинки от spritesheet). Карта также может состоять из Z слоёв.