Направляющими. Ставим по вертикальным границам элементов и получаем ритм. Если сайт информационный, то ритм задает текст - собственно ставим там по границам строк направляющие и считаем расстояние между ними.
Если про создание - то поставьте сетку в 6px по вертикали, всегда найдете место под нужные элементы, они "сами туда попросятся". Хотя 6px больше для текста и мелких элементов. Можно 5 и 10 пикселей, но мне нравится 6, т.к. много элементов имеют размеры 18 24 36. Например текст 14, межстрочное расстояние 18, первый заголовок 36, второй 30 далее до шестого 24 18 14 12