Чат использует mongodb
И есть некая система, где пользователь зарегистрирован, + ко всему эта система должна периодически анализировать тексты и записывать результаты анализа в таблицы.
Предполагаю, что в базу данных mySQL достаточно записать ID записи из монги.
Вообще связывают данные в разных базах данных?