как разрешить работать программе через брандмауэро чем речь?
только автоматически?гуглить создание сервисов/заданий шедулера для выбранной ОС
Например через реестрможно, но для разных языков программирования по разному. гугл же для этого
суть - вы все равно просите обход защиты. ее не надо обходить. ее надо правильно настроить (о чем собственно камент..подробности в каментах