Скрипт запускает test.exe через командную строку.
После его выполнения test.exe скрипт завершается, так как в ехешнике заложено автоматическая остановка после его выполнения.
Нужно же принудительно продолжить выполнение скрипта после test.exe. Ехешник изменить возможности нету.
Как это можно сделать?
import os
os.system('cmd /k "test.exe" -i input -o output')
print ("Программа выполнена. Запуск следующей...")