Добро пожаловать в
2020 год.
Проект - это не только файлы в папке, это еще и настроенный интрпретатор, коннекты к БД, команды запуска и прочее. При открытии сферического py-файла в вакууме всё это не подтягивается, а интеллектуальные функции ограничены. Запускайте PyCharm через пуск, отрывайте свой проект и создавайте новые файлы через меню PyCharm.