Для MySQL 8.0:
SELECT * FROM `t1` WHERE `id` IN (SELECT `id_iz_pervoi_tablici` FROM `t2` WHERE `flag`=0)
Более быстрый вариант (но это не точно):
SELECT * FROM `t1` WHERE EXISTS (SELECT * FROM `t2` WHERE `t1`.`id` = `t2`.`id_iz_pervoi_tablici` AND `flag`=0)