Эмм...
01. Перейти на dashboard.heroku.com/apps
02. Выбрать вашего бота
03. Далее Deploy
04. Пролистать вниз и
05. Нажать на Deploy Branch
Если чуть выше нажать на Enable Automatic Deploys, то при каждом обновлении бота на гитхабе heroku будет сам разворачивать новую версию у себя...