в API есть метод
getElementAtEvent, правда через него можно получить доступ только к элементам графика, см
пример, при клике на элемент (точку) можно получить ее значения по осям.
или через helpers вычислять положение клика на канвасе и сопостовлять с положением меток.
см.
пример (он правда для radar, для line придется переписать определение положения меток)