Смотря что закладывается в понятие "прототипирование интерфейсов", если черно-белый набросок, то да - Axure RP.
Что касается UX/UI, рекомендую почитать книги, которые подойдут для менеджера проектов:
Майк Монтейро «Дизайн — это работа» - поможет грамотно презентовать дизайн проекты и научится руководить дизайнерами.
Психбольница в руках пациентов - Купер - подтянет навыки UX-проектирования, в основном увидите в ней проблемы из прошлого и как их можно решить. Очень будет полезно прочитать менеджеру проекта.
Не заставляйте меня думать - Алан Купер - просто библия, для всех кто связан с интерфейсами.
Эти три не больших книги, введут вас в курс дела и научат мыслить по другому, в области UX.