Просто пишете все скрипты отдельно в крон.
Крон попытается их запустить.
Крон не гарантирует, что все скрипты запустятся ровно секунда-в-секунду, но постарается запустить все, что запланировано на эту минуту. В обычном случае, если машина не перегружена, обычно все запускается в нулевую или первую секунду.
Но если какая-то задача из-за загрузки сервера не смогла запуститься за целую минуту, она может быть пропущена кроном.