Все блоки на странице, которые улетают наверх, имеют абсолютное позиционирование. При нажатии на ссылку в меню происходит запрос на сервер за данными выбранной страницы, и, после их получения, у блоков текущей страницы анимируется свойство top в отрицательную сторону. Через небольшой интервал на их место вставляется контент загруженной страницы