Не важно зависимость yii это или нет. Yii2 может работать с 5.4 поэтому в composer.json указано "require": "php": ">=5.4.0". Для myclabs/deep-copy требуется php 7.2 поэтому в нем указано "require": "php": "^7.2". Очевидно, что при установке yii2 и компонента myclabs/deep-copy, разрешив зависимости, тот же composer забракует 5.4, т.к. хотя для yii2 этого достаточно, но уже недостаточно для myclabs/deep-copy.
Нужно обновлять php, потому что даже если и решите эту проблему, завтра возникнет подобная с другим компонентом.