Нельзя автоматически делать, т.к. вы не сможете анализируя только html код, удалить неиспользуемые классы, т.к. вероятно, эти классы будут добавляться через js, или использоваться на других страницах. Так можно лишнее удалить.
Нужно вручную, при помощи инструментов. В хроме в devtools есть крутой инструмент code coverage, заходите на страницу, жмете запись, и он показывает, какие строки в css/js были выполнены (использованы в случае css). Заходите в предлагаемые файлы, и там каждый неиспользуемый на данной странице css блок, будет выделен красным цветом, читаете его и смотрите, точно ли вы не где не могли его использовать.
Подробнее тут
https://developers.google.com/web/updates/2017/04/...
https://medium.com/devschacht/using-the-chrome-dev...