Если логотипы находятся внутри div, к которому добавляется класс scrolled, то можно решить все цссом, если нет, тогда надо добавить в скрипт добавление класса scrolled для обертки логотипов
А CSS для смены логотипов при добавлении класса scrolled такой:
.logo-1 {
display: block;
}
.logo-2 {
display: none;
}
.scrolled .logo-1 {
display: none;
}
.scrolled .logo-2 {
display: block;
}