Немного покопался в настройках VC code и теперь терминал почему-то запускать всё как бы из главное директории папки.
Т.е. примерно так:
Папка1 -> Папка2 -> Скрипт.py
И проблема в том, что раньше,например какой нибудь, который лежит в той же папке открывался без указания пути, а теперь приходится прописывать начиная от главной папки проекта, что неудобно :\
Перерыл интернет, но ответа не нашел. Уже и переставил полностью весь VC code, проблема решилась.