Зачем вам
Portage SQL вообще в винде?
Наверное, речь всё-таки о PostgreSQL.
Сравнение двух таблиц - банальный стандартный FULL OUTER JOIN
select * from t1 full outer join t2 using(id) where (t1.*) is distinct from (t2.*);
Сравнение баз - вероятно удобнее будет чем-то внешним.