Необходимо сделать экспорт базы и возникает вопрос - а как будет работать сама база во время экспорта?
Изменения базы на время экспорта блокируются?
Если нет - то какие данные будут получены в таблице x, если во время экспорта туда будет добавлена запись?
А как она у Вас бэкапится и почему нельзя взять дамп из бэкапа?
Вариантов не много - либо запись в БД будет блокироваться при экспорте, либо может не всё экспортироваться.
Для mysqldump есть опции --lock-tables=false или --single-transaction=TRUE для InnoDB.