Но на некоторых проектах активно используются jquery плагины. Их подключение в WebPack иногда очень нетривиально.
Очень даже тривиально.
Шарите переменную jQuery в глобальный скоуп, и потом просто импортируете скрипт плагина, а далее обычным образом его инициализируете.