Есть FreeBSD 10.3-STABLE. Чисто сервер, без иксов. Необходимо подключить к нему через USB Arduino Nano.
Должен работать обмен данными через виртуальный COM-порт.
Попробовал IDE для работы с Arduino - работает под Windows.
Но, чтоб все время не отключать и не таскать к компу с Windows для отладки проекта нужно также обновлять прошивку из консоли FreeBSD.
Т.е. поправил любым редактором - тем же ee или vi файлик - и нужно скомпилировать и отправить на ардуино.