Вставьте фрагмент кода в файл functions.php вашей темы:
<?php // Mind this opening php tag
/**
* Remove Categories from WooCommerce Product Category Widget
*
* @author Ren Ventura
*/
//* Used when the widget is displayed as a dropdown
add_filter( 'woocommerce_product_categories_widget_dropdown_args', 'rv_exclude_wc_widget_categories' );
//* Used when the widget is displayed as a list
add_filter( 'woocommerce_product_categories_widget_args', 'rv_exclude_wc_widget_categories' );
function rv_exclude_wc_widget_categories( $cat_args ) {
$cat_args['exclude'] = array('55','68'); // здесь ID вашей категории
return $cat_args;
}