Немного помучался, но все таки решил проблему. Дело в том, что я испльзую виртуальные рабочие столы и с помощью compiz задал для каждого стола свой фон. Но при этом, правой кнопкой мыши на рабочем столе я установил фоновую картинку, которая и отображается при входе в систему.
Проблема в том, что я решил помеять обои на каждом экране и удалил то изображение, которую установил из контекстного меню на экране.
Решил так же просто, выбрал установить фоновое изображение из контекстного меню и задал новую картинку.