Если кто-то ещё раз столкнется с этой проблемой, то обязательно проверьте:
1.
Пример
2. Flash
настройки
3. Обновитесь, возможно проблема уже была исправлена
4. Посмотрите github
issue, возможно мы уже знаем о проблеме и решаем её.
P.S. Проблема TC возможна только в Opera < 12 (если «криво» настроен/работает флеш) и Android default browser, они обладают только частичной поддержкой File API, это было исправлено в последней версии 1.2.6.