1. Команда для создание сборки проекта, можете ее повесить на крон:
./console phpci:create-build [--commit <commit-hash>] [--branch <branch>] <project_id>
2. PHPCI "из коробки" так не умеет. Добиться этого можно только изменением кода Webbhook контроллера для Bitbucket-а.