Для начала разберитесь с администрированием.
накатил на него Весту, чтобы было проще администрировать
/home/admin/web/
Молодец, продолжай в том же духе. Запускать скрипты от имени администратора отличная идея.
Адрес домашней директории небходимо указать в конфигурации хоста. У вас это может быть как Nginx, так и Nginx+Apache2