Проблема в том, что вы используете Oracle JDK - это самая распространённая причина проблем с перфомансом.
Вы можете скачать наш JDK здесь: https://bintray.com/jetbrains/intellij-jdk/openjdk...
Инструкция по переключению между JDK: https://intellij-support.jetbrains.com/hc/en-us/ar...
попробуйте переименовать папку %UserProfile%.PhpStorm2016.2 и запустите ещё раз. Не импортируйте настройки.