Воспользуйтесь
cron.
Для запуска скрипта по крону после перезагрузки сервера используется конструкция @reboot. Добавляем в наш crontab:
@reboot sh /path/to/your/your_program
Пример с задержкой 60 секунд:
@reboot /bin/sleep 60 ; sh /path/to/your/your_program