Вообще, что бы пользоваться всеми прелестями bootstrap проще его использовать как less файлы, подключить к своему less файлу, который модифицировать, а потом делать из него bootstrap.min.css
тогда не надо будет переопределять кучу стилей. что бы получить кнопку в новом цвете, а достаточно будет переопределить 1 переменную