Смотрите, у Брюса Шнайера на сайте есть список реализаций этого алгоримта.
По
ссылке в самом низу.
Вот
одна из таких реализаций.
Там есть класс Threefish, унаследованный от System.Security.Cryptography.SymmetricAlgorithm,
поэтому его использование будет выглядеть примерно также, как и использование других наследников этого класса.