<ul class="nav navbar-nav">
<li class='fake'><a href='parentlink'>Ссылка</a></li>
<li class="dropdown">
<a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" aria-expanded="true" href="parentlink">Ссылка<span class="caret"></span></a>
...
</li>
<li class='fake'><a href='parentlink2'>Ссылка2</a></li>
<li class="dropdown">
<a class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" aria-expanded="true" href="parentlink2">Ссылка2<span class="caret"></span></a>
...
</li>
Класс fake сверстать так, чтобы находился поверх следующего li class="dropdown", но не его каретки.
Тогда при клике на текст ссылки будет переход по ссылке, при клике на каретку - раскрытие дочернего меню.
<li class='fake'><a href='parentlink'>Ссылка</a></li>
лучше добавлять через JS, тогда на этапе разработки не будет проблем с дублированием ссылок.