$text = 'Создадим разметку <code lang="xml"><div>title</div></code> тест';
$text .= 'Создадим разметку2 <code lang="php"><div>title2</div></code> тест2';
$pattern = '/<code.*>.*<\/code>/i';
$replacement = '<pre></pre>';
$text = preg_replace($pattern, $replacement, $text);