Во первых - во время редактирования и создания winforms не учитывается две вещи - текущая тема и DPI. Попробовать скинуть их к стандартным значениям и попробовать запустить.
stackoverflow.com/questions/22735174/how-to-write-... также посмотрите эту ссылку
Во вторых - пробегитесь по коду, может быть при запуске, после InitializeComponent (а иногда и до) есть код меняющий вид формы.
В третьих - это у вас в конкретном проекте такая проблема или в любом? (в том числе вновь созданном?)