так у них же об этом в документации и написано
"Grid images are not exact. Browsers have extra trouble with sub-pixel rounding on background images. These are meant for rough debugging, not for pixel-perfect measurements. Expect the to side of your grid image (right if your flow is ltr) to be off by several pixels."
если коротко: браузеры не умеют правильно округлять субпиксели, поэтому врядли когда-нибудь нарисованная сетка совпадет с реальной. да и не нужно это особо, главное что видно сколько колонок занимает блок