блокируются скрипты одной сессии
делай примерно так
<?php
passthru("/usr/bin/php /path/to/script.php ".$argv_parameter." >> /dev/null 2>&1 &");
?>
или заменить на exec. Суть в том, чтобы запустить процесс и отвязаться от него. Можно еще еще покопать thread'ы, но сам не сталкивался с ними.