> Как лучше хранить данные GeoJson в БД?
Геометрию - в колонке геометрического (или географического, смотря что вам нужно) типа, остальные свойства фич - в колонках соотв. типа.
> Если хранить пространственные данные в БД, то где потом лучше формировать сам GeoJson?
на бэкенде при передаче фронтэнду, на фронтэнде - при передаче бэкенду
Т.к. в реляционных СУБД и так уже придумали, как работать с геометрией, то не вижу смысла в GeoJSON хранить. В какой-нибудь Монге - другое дело, но не в MySQL. А вот для передачи геоданных GeoJSON вполне ничего, поэтому и логичный вывод, где что формировать.
Вообще странный вопрос, будто у вас основная задача не саму фичу передать и сохранить, а сохранить GeoJSON.
Простой
