Предположу, что самый верный вариант здесь — собрать из исходников и Mono, и MonoDevelop (если мне не изменяет память, в репозитории 14.04 Mono довольно древний лежит).
Сборка Mono описана
здесь или
здесь.
Инструкция по установке MonoDevelop — например,
здесь, думаю, и для 5.x это сработает. Вот есть
еще одна инструкция для 14.04.
От себя добавлю, что вместо
make install
лучше использовать
checkinstall.