Если я правильно помню, то битрикс выдаст тебе URL при выборке какой нужно, то есть просто опустит раздел.
А если хочешь сделать правильную обработку таких урлов, то придется ручками написать комплексный компонент, который будет проверять количество переданных в урле параметров и, если он один, проверять, является ли он кодом элемента или кодом раздела. При этом нужно еще следить за уникальностью таких кодов. Короче, оно того, как мне кажется, не стоит, лучше сделать ссылки типа news/item/#CODE# для элементов и news/#CODE# для разделов и не париться.