Чуть чуть позанудствую - это префикс а не суффикс)
У меня есть личное мнение что использование префиксов к названиям таблиц пошло от дешевых shared хостингов и попыток запихать несколько разных инстансов CMS в одну базу (что бы не платить за базы)
На практике используем следующее (личный опыт, не буду утверждать что только так правильно):
В названиях баз суффиксы:
projectname_development
projectname_release20150120
projectname_tip
итд
некоторые создаются/удаляются автоматом при автотестировании.
В названиях таблиц суффиксы/префиксы не используются за исключением кроссовых таблиц - у них всегда префикс xref
xref_post_tag - таблица задающая соотношение между постами и тэгами.
В колонках префиксом всегда является название сущности.
Таблица user, поля user_id, user_name, итд.
Изначально слегка раздражает необходимость это писать, особенно если сущность называется длинным словом, но потом привыкаешь + нет путаницы когда сложные запросы.