Если у вас один сайт на хосте, и не надо заморачиваться с правами, то worker будет лучше, все таки порождение нового процесса потяжелее будет. Да памяти кушать меньше будет.
Но если что-то будет падать, то в prefork пострадает только один процесс, а в worker ситуация может быть более плачевная.
В общем погуглите prefork vs worker. Однозначного ответа не будет, надо выбирать по ситуации.