Корень проблемы в том, что в концепцию тач-интерфейса фиксированно спозиционированные элементы не очень хорошо вписываются.
Единого решения этого
бага нет, есть небольшой список рекомендаций от
человека,
потратившего много усилий на решения проблем зафиксированных элементов на тач-устройствах, который можно сократить до одного пункта: не используйте элементы с position: fixed в скроллируемых элементах.
Возможно, можно пересмотреть ui сайта и отказаться от зафиксированных элементов, либо скроллить не всю страницу, а некий контейнер, рядом с которым и находится зафиксированный элемент.
А, возможно, стоит прекратить обращать внимание на это поведение: оно уже привычно для пользователя и от того вполне легально.