Есть избранное, туда можно добавить наиболее часто используемые фалы или папки.
Есть переход к текущему файлу в дереве, как только переключаемся на него (раньше надо было выбрать команду в контекстном меню, сейчас вроде по умолчанию такое поведение).
Есть поиск по проекту, где можно задавать как искомый текст (не очень быстро, несмотря на индексацию), так и название файла (очень быстро).
Используйте окна проектов, файлов, избранного и навигатор и будет Вам счастье.