добавь в вирутальную vmware с нужным тебе диском загрузочный диск какой-нибудь утилиты резервного копирования и скопируй как raw.
самый тупой пример, берешь livecd ubuntu, загружаешься, монтируешь по сети целевой диск, куда сложить файлы (если тебе сразу диск нужен, советую nbd например идет в поставке с qemu, во всех вариациях как сервер так и клиент) и копируешь с помощью dd или partclone (он, зная файловую систему будет пропускать не занятые сектора, что еще быстрее)