Для редактирования используйте палитру слоёв. В компоненте Terrain, раздел редактирования (кисть) в самом верху есть выпадающий список, откройте пункт Paint Textures.
Если у вас нативный Terrain, то ближе к верху, а если Terrain Tools, то почти в самом низу инспектора ищите что-то типа Terrain Layers. Эти слои как палитра в пеинте/фотошопе, создаёте и рисуете им. Единственное замечание, самый первый станет фоновым, им закрасится весь рельеф.
Сами Terrain Layer-ы это файл по типу материала, создаются во вкладке Project, в меню они почти в самом низу.
Если же настроенные и добавленные к рельефу слои не рисуют, то нужен скриншот палитры (в коменты), а лучше всей вкладки Inspector. А также скриншот настроек (вкладка Inspector) одного или парочки слоёв рельефа.