Суть ошибки проста: DBeaver не может подключиться к локальной базе данных (MariaDB):
Socket fail to connect to host:address=(host=localhost)(port=3306)(type=primary). Connect timed out
Connect timed out
Возможность подключения к бд через консоль есть, сервер запущен.
Проблема возникла после обновления клиента DBeaver до 22.3.5.