можно синхронизировать с использованной темой file->preferences->settings->Window затем находите Title Bar Style устанавливаете его в custom по умолчанию там (native). Далее он спросит о том что изменения требуют перезапуска, соглашаетесь и все. Далее ваше меню будет следовать установленной цветовой теме и при ее изменении цвет меню будет меняться вместе с ней.