Насколько мне известно - никак, т.к. это глобальные настройки. Если я правильно понял вашу задумку, вы можете выехать за счёт возможности источников освещения светить только на объекты выбранного типа. У компоненты Light самое нижнее свойство - Culling Mask - слои, на которые данный свет способен светить. Аналогичная настройка есть и у камеры.
Вы можете создать набор слоёв, видимых разными камерами по-разному и также по-разному освещаемыми двумя разными источниками.